Το Τμήμα Περιβάλλοντος και Υδροοικονομίας σύμφωνα με το άρθρο 20 του Ν.4014/2011 όπως και τα Κλιμάκια Ελέγχου Ποιότητας Περιβάλλοντος των Περιφ. Ενοτήτων, έχουν την αρμοδιότητα των περιβαλλοντικών επιθεωρήσεων σε έργα και δραστηριότητες της χωρικής αρμοδιότητάς τους.
Αρχικά θα γίνει περιληπτική αναφορά (αριθμητικά) σε ελέγχους που πραγματοποιήθηκαν από το Τμήμα και το ΚΕΠΠΕ της ΠΕ Χανίων από το 2012 έως 2016 και ο αριθμός των διοικητικών κυρώσεων που επιβλήθηκαν καθώς και των περιπτώσεων που στάλθηκαν στον Εισαγγελέα.
Από την διεξαγωγή των ελέγχων, οι οποίοι προκύπτουν έπειτα από καταγγελίες πολιτών και φορέων, έγγραφα υπηρεσιών κλπ., προκύπτουν διάφορα προβλήματα όπως:
Μετά την ολοκλήρωση των ελέγχων και την επιβολή των διοικητικών κυρώσεων (άρθρο 30 του Ν. 1650/1986) ακολουθεί η διαδικασία του άρθρου 28 του Ν. 1650/1986 της διαδικασίας των ποινικών κυρώσεων από τις αρμόδιες δικαστικές αρχές, με τα στάδια της προανάκρισης και της κλήσης στο δικαστήριο του αρμόδιου υπαλλήλου της Υπηρεσίας ως μάρτυρα και την διεξαγωγή της δίκης.
Αναφορά στο πρόβλημα της χρονικής διάρκειας της διαδικασίας, εξαιτίας των αναβολών της διεξαγωγής της δίκης, της απώλειας εργατοωρών των υπαλλήλων και της μεγάλης χρονικής απόστασης μεταξύ της περιβαλλοντικής παράβασης μέχρι την τελική διεξαγωγή της δίκης. Σ υζήτηση γ ια τα θ ετικά και τα αρνητικά τ ης χ ρονικής καθυστέρησης.
Όσον αφορά για την προστασία της βιοποικιλότητας θα αναφερθεί το παράδειγμα ελέγχων τήρησης των μέτρων της προστασίας της θαλάσσιας Χελώνας στις παραλίες στον κόλπο Χανίων από τον Σταλό έως το Κολυμβάρι. Αναφορά στη διαδικασία ενημέρωσης των τουριστικών επιχειρήσεων, στους ελέγχους που πραγματοποιήθηκαν και στην επιβολή κυρώσεων του τμήματος Περιβάλλοντος και ανάδειξη των προβλημάτων εξαιτίας της έντονης τουριστικής ανάπτυξης. Αναφορά στην συμμόρφωση ή μη στη τήρηση των μέτρων έπειτα από τους ελέγχους.